תנאי ההסגר נקבעים בהתאם להערכת הסיכונים הטמונים ביבוא. הערכת הסיכונים מתייחסת למזיקים או גורמי מחלה העלולים לגרום נזק לצומח, שאינם קיימים או קיימים בארץ בתפוצה מוגבלת ועלולים להגיע עם החומר המיובא ואף להתבסס בארץ. הערכת הסיכונים מתבצעת בהתאם לסוג הגידול המיובא, חלק הצמח המיובא (זרעים, ייחורים, תרבית רקמה וכן הלאה) וארץ המקור שבה גדל.
מידע נוסף על הערכת סיכונים ניתן למצוא בקישור הבא (קישור לדף הערכת סיכונים).
תנאי ההסגר כוללים מספר מרכיבים:
- הגדרת המפרט הטכני של מתקן ההסגר ('קרנטינה') בהתאם לסוג הנגעים אותם אנחנו רוצים למנוע את בריחתו מהמתקן
- משך הזמן שבו ישהה הצמח המיובא במתקן ההסגר
- הגדרת הבדיקות והטיפולים הנדרשים במהלך תקופת ההסגר
- פיקוח ויזואלי במהלך תקופת ההסגר.