נגיף ממשפחתPicornaviridae מסוג Aphtovirus. קיימים שבעה זנים / טיפוסים שונים של נגיף: A, O, C, SAT1 ,SAT2 ,SAT3 ו- ASIA. לכל זן/טיפוס קיימים ווריאנטים שונים. סך הכל ידועים למעלה מ-80 תת-טיפוסים לנגיף. נוגדנים כנגד זן אחד אינם מגנים מפני זן אחר של הנגיף. בישראל הזן הנפוץ והשכיח ביותר הוא זן O. הזן ASIA1 הופיע פעמיים בלבד ב- 25 השנים האחרונות.
לאחרונה, בשנת 2009, אובחן הזן שגרם למחלה כזן A (תת טיפוס: iran-05) אשר גרם להתפרצויות גם בבחרין, מצריים, עיראק, איראן, לבנון, לוב וטורקיה.
הנגיף דווח גם בירדן בשנת 2006.
לפני 2009, השנה האחרונה בה הופיע זן A בישראל היתה ב-1981 (תת טיפוס A-22).